Tedavi hastanın durumuna, tümörün cinsine, tümörün yemek borusunda yerleşimine ve yayılımına bağlı olarak değişebilmektedir. Hastalar cerrah, medikal onkolog ve radyasyon onkoloğundan oluşan bir ekip tarafından değerlendirilir ve bulgular eşliğinde tedavi edilirler.
Hastada tümör ileri evrede değilse ve başka organ tutulumu yoksa ilk tedavi cerrahi ile tümörlü özefagusun çıkarılmasıdır. Özofajektomi özofagusun çıkarılma işlemine verilen isimdir. Bu işlemde özofagusun çevresindeki lenf bezleri de çıkarılır. Hastanın yutmasının sağlanması için değişik yöntemlerle mideden ya da ince ve kalın bağırsaklardan yapılan yeni yemek borusunun yerleştirilmesi ile operasyon tamamlanır.
Radyasyon Tedavisi (Radyoterapi): Kanser hücrelerinin yüksek enerjili ışınlar ile öldürülmesi işlemidir. Sıklıkla ameliyat öncesinde tümörü küçültmek için kemoterapi ile kombine edilerek kullanılır. Bazı durumlarda ameliyat sonrası nüksleri engellemek amacı ile de uygulanabilir. Radyoterapi tedavisi özellikle tümörün yerleşimi ve büyüklüğü cerrahiye imkan vermiyorsa cerrahinin yerine tek başına veya kemoterapi ile birlikte de kullanılabilir.
Kemoterapi: Kanser hücrelerini öldürmek için kullanılan ilaçlar ameliyat öncesinde tümörü küçültmek için veya ameliyat sonrası tekrarlama olasılığını azaltmak için radyoterapi ile birlikte kullanılabilir. Ameliyat şansını kaybeden ileri evredeki hastalarada sıklıkla tek başına kullanılan tedavi yöntemidir.
Palyatif Tedavi Yöntemleri: Hastaların bir kısmında tümör sonucu oluşan özefagus tıkanıklığı bulunan alana stent adı verilen genişletici şemsiye uygulaması yapılarak besinlerin rahat geçmesi sağlanır. Özefagustaki tıkanıklığı açmak için kullanılan bir diğer yöntem lazer uygulamasıdır. Mideye gastrostomi adı verilen hortumlar yerleştirilerek dışarıdan beslenme sağlanabilir.